微生物分类鉴定的基础是

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微生物分类鉴定的基础是对大量单个微生物进行观察、分析和描述，以它们的形态、结构、生理生化反应和遗传性等特征的异同为依据，并根据生物进化的规律和应用方便来进行分类鉴定。例如通过形态结构观察（包括细胞的形状、大小、排列方式、细胞结构及染色特性等），不同微生物在这方面存在差异，细菌有特定的细胞结构，霉菌有分支的丝状体等；微生物在固体培养基上形成的菌落特征（如大小、形态、颜色等）、在液体和半固体培养基中的生长特征等也有不同，可用于区分鉴定。生理生化反应也是重要依据，像尿素酶试验、氧化酶试验、过氧化氢酶的测定等生化反应，不同微生物的代谢产物不同，这些反应可用于鉴别在形态等方面不易区别的微生物。此外，微生物的遗传性特征，如核酸分析（通过比较DNA的碱基数目和排列顺序来判断亲缘关系）、DNA杂交试验（根据杂合率判断亲缘关系）等，也是微生物分类鉴定的基础。细胞壁成分分析（不同微生物细胞壁组成和结构有特殊性）、红外光谱（利用每种物质特定的红外光谱测定微生物化学成分来分类）以及数值分类法（根据“等重要原则”分析多数特征，计算菌株间总相似值来分群归类）等也在微生物分类鉴定的基础范畴内。
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