西湖实验室
一图读懂丨西湖实验室王寿文、李莉团队合作开发谱系追踪新计算工具MethylTree
2025-01-17
2025年1月16日,西湖实验室王寿文团队与李莉团队合作,在Nature Methods上发表题为“High-resolution, noninvasive single-cell lineage tracing in mice and humans based on DNA methylation epimutations”的最新成果。他们在单细胞谱系追踪领域取得了突破性成果,开发了一款谱系追踪新计算工具MethylTree。这款工具无需基因编辑,就可以精准地、以多组学的方式追踪细胞谱系,开启了非侵入式谱系追踪的新篇章,为研究人类组织发育、疾病发生机制和干细胞疗法提供了很多可能性。

论文截图
论文链接:
https://www.nature.com/articles/s41592-024-02567-1
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什么是细胞谱系
MethylTree怎样发挥作用
如何实现精准谱系追踪
我们带你一图读懂

陈孟旸和傅瑞江同学为文章的共同第一作者,李莉研究员为共同通讯,王寿文研究员为文章最后通讯作者。团队感谢西湖大学的李党生、于洪涛、张垲和浙江大学的刘琬璐、阮登峰、郭红山,也感谢西湖大学高性能计算中心的支持。
王寿文课题组简介与招聘信息
王寿文,于2023年3月加入西湖,担任西湖大学生命科学学院特聘研究员、博士生导师,西湖实验室研究员,同时任西湖大学理学院物理系兼聘教授。近几年来,以通讯作者(含共同)身份在Cell、Nature Methods、Nature Biotechonology、Nature Communications、Nature Protocols等杂志发表多篇研究论文。
王寿文课题组紧密结合计算与实验方法,致力于前沿谱系示踪技术的开发与应用,尤其是以DNA甲基化为代表的非侵入式、多组学谱系追踪方法的进一步开发与在人体中的应用。课题组已经搭建起多个谱系示踪实验平台,形成了计算与实验多学科交叉的良好氛围。王寿文课题组长期招聘副研究员、助理研究员以及科研助理,欢迎拥有实验或计算背景、且对谱系示踪前沿方向有热情的青年才俊加盟。
实验室主页:
https://www.shouwenwang-lab.com/
联系方式:
李莉课题组简介与招聘信息
李莉,于2024年初加入西湖,担任西湖大学生命科学学院特聘研究员、博士生导师,西湖实验室研究员,建立谱系示踪与表观遗传调控实验室。近年来,在Cell、Nature Methods、Cell Stem Cell 和Cell Research等杂志发表多篇研究论文。
李莉课题组一方面运用已建立的多组学谱系示踪小鼠模型研究发育过程和炎症与免疫过程中的细胞命运调控机制,另一方面致力于开发新一代的谱系示踪动物模型和测序技术,为全面解析细胞命运并开发新型细胞疗法奠定基础。李莉课题组长期招聘副研究员、助理研究员以及科研助理;欢迎具有计算基因组学或实验生物学背景的有志青年邮件联系!
实验室主页:
https://lili-lineagelab.com/
联系方式:
网址:西湖实验室 https://mxgxt.com/news/view/1978909
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